Clima
Clima este siberiană în nord, cu ierni aspre, și tropicală în jumătatea sudică.
Vegetația
Vegetația se încadrează în Subregiunea floristică Chino-Japoneză. Caracteristic pentru aceasta zonă sunt pădurile temperate umede și cele umede subtropicale. Cele temperate sunt reprezentate prin păduri de conifere, de foioase etc., iar cele subtropicale prin magnolii, bambuși, liane, etc.
Fauna
Fauna aparține subregiunilor Euro-Siberiană și Chino-Manciuriană (ursul japonez, maimuța japoneză, cocoșul japonez). Diversitatea și unicitatea peisajului arhipeleagului japonez a determinat considerarea a numeroase regiuni drept parcuri naționale.